约70％本症患者有痛经且多为继发性、逐渐加重。常见腰骶部或下腹疼痛，可放射到阴道、会阴、肛门及大腿处。月经前1～2天即感不适或疼痛，经期1～2天最强，以后逐渐减弱，月经干净后消失。少数病人严重痛经难以忍受，伴恶心呕吐，四肢冰冷，甚至晕厥；还有的经期过后仍觉腰痛、下腹痛。

常表现为月经血量增多或经期延长，淋漓不净。也有在月经中期出现点滴阴道出血者。

性交痛多见于子宫骶韧带、子宫直肠陷窝的异位症，尤其病变扩散到阴道后穹窿时则有更明显的性交痛。这些患者在经期常有肛门憋坠感或排便痛，有时还可在经期出现软便或稀便。

常伴有原发性不孕或继发性不孕。